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美國國家航天航空局(NASA)計(jì)劃在宇宙空間站進(jìn)行測序?qū)嶒?yàn)

發(fā)布時(shí)間:2016-11-23 11:19:49

      7月18日,美國國家航天航空局(NASA)將往國際空間站(ISS)運(yùn)送下一批物資及科研設(shè)備,其中括含牛津大學(xué)的MinIon納米孔測序設(shè)備。空間站的宇航員將利用其對細(xì)菌,病毒及小鼠的DNA進(jìn)行測序,并將這些數(shù)據(jù)將傳送回來,與地球上測得的結(jié)果進(jìn)行比對。

  MinIon納米孔測序儀

  約翰遜航天中心的微生物學(xué)家Sarah Wallace認(rèn)為,目前來說,MinIon是唯一一個(gè)可以放心在宇宙空間使用的測序儀。她告訴記者,儀器的大小是它的優(yōu)勢之一,而且和Illumina以及Sanger法測序儀器不同的是,MinIon對于震動不敏感,另外耗電量也較小。

  雖然,人們想對更多的微生物進(jìn)行測序,但是MinIon在微重力的環(huán)境下工作的可靠性還需要進(jìn)行確認(rèn)。其中一個(gè)擔(dān)憂是樣品放入機(jī)器時(shí)會產(chǎn)生氣泡,雖然這在地球上并不是什么大問題。放置樣本的這一過程設(shè)計(jì)需要考慮到與航空工作環(huán)境相兼容。NASA還希望該系統(tǒng)可以滿足在ISS上分析測序數(shù)據(jù)的需求。

  Wallace希望MinIon在ISS的研究可以為地球上的研究者所用。ISS作為一個(gè)國際性的實(shí)驗(yàn)室, 如果這項(xiàng)研究可以進(jìn)行, 那么該研究成果可以與整個(gè)學(xué)術(shù)界共享。

  MinIon測序儀的其它應(yīng)用

  MinIon測序儀還有其他應(yīng)用,Wallace的同事Aaron Burton一直在嘗試著使用MinIon來探測其它星球。因?yàn)樗c其它測序儀完全不同的工作機(jī)制,它可以主動尋找DNA,RNA和蛋白質(zhì),如果對納米孔進(jìn)行修飾,也許可以通過它來尋找不同種類的核酸。

  Burton 說:“在我所了解的技術(shù)中,這是唯一一個(gè)可以用來尋找未知的儀器,我可以利用它找出一個(gè)樣本中所有的細(xì)菌,而不像PCR,我需要知道特異性的引物,然后去尋找已知的序列。這項(xiàng)技術(shù)剛好滿足了我們尋找未知序列的要求?!?/span>

  NASA工作計(jì)劃

  NASA計(jì)劃于7月18日將MinIon運(yùn)往NASA極端環(huán)境任務(wù)操作間(NEEMO),這是一個(gè)水下工作站,位于弗羅里達(dá)Key Largo海岸線上。在這個(gè)模擬的宇宙工作站中,研究者和工程師也會進(jìn)行同樣的測序?qū)嶒?yàn)。其余科學(xué)家已經(jīng)為在宇宙空間站的實(shí)驗(yàn)做好準(zhǔn)備,確保儀器在空間站的工作與在地球一樣。

  Bruce Hammer是明尼蘇達(dá)州中心大學(xué)磁共振研究所的教授,他曾建議開展針微重力環(huán)境下骨小體的組學(xué)研究。在NASA的電話會議上Hammer教授說,他們將會對7月18日運(yùn)送到ISS的骨小體樣本進(jìn)行基因表達(dá),蛋白表達(dá),兩種表達(dá)之間的關(guān)系以及骨小體新城代謝水平的研究。這項(xiàng)研究預(yù)計(jì)將于九十月份開始,宇航員會先解凍這些細(xì)胞。一旦該實(shí)驗(yàn)開始,他和他的同事將會對在ISS上得到的數(shù)據(jù)與地球上模擬微重力環(huán)境下得到的數(shù)據(jù)進(jìn)行對比。